明治 ５年 「有年学校」として設立
明治１９年 東南海地震により北校舎が倒壊
昭和２２年 「飛島村立飛島小学校」と改称
「飛島村立飛島中学校」創立
昭和３４年 伊勢湾台風が来襲
昭和４２年 中学校の給食室が完成し、完全給食を開始
平成１４年 東海地震に係る地震防災対策強化地域に指定
平成１５年 飛島村立学校施設等検討委員会を設置
平成１６年 飛島村小中一貫教育及び教育特区研究会設置
平成１７年 飛島村大字松之郷地内への移転を決定する
平成１８年 小中一貫教育を開始
小中一貫校建設委員会を設置
平成１９年 用地買収、造成工事
平成２０年 小中一貫校建設工事（平成２０年、２１年２ヶ年工事）
平成２１年 小中一貫校建設工事、グラウンド整備工事が完成
平成２２年 小中一貫教育校「飛島学園」を開校
令和 ２年 義務教育学校 「飛島村立飛島学園」を開校